Java, Padang dan Palembang (kedua-duanya di Sumatera), Makassar dan Manado (kedua-duanya di Sulawesi) dan Timor secara rasminya diserahkan kepada Britain. Raffles telah dilantik sebagai Leftenan Gabenor Jawa. Beliau telah menamatkan kaedah pentadbiran Belanda, meliberalkan sistem pajakan tanah dan perdagangan. Pada tahun 1816, Britain mengembalikan semula Jawa dan pegangan Hindia Timur yang lain kepada Belanda sebagai sebahagian persefahaman yang menamatkan Perang Napoleon.